Nacida en Roma, Labate comenzó su carrera como directora de televisión. En la década de los 80 empezó a trabajar en el campo del cine documental. Ha realizado los siguientes largometrajes: Ambrogio (1992), La Mia Generazione (1996) y Signorina Effe (2007), que se estrenó en el Festival de Cine de Turín.
Labate también es autora y en 2005, junto con Fausto Bertinotti, líder político de la Izquierda Europea, escribió el libro autobiográfico Il ragazzo con la maglietta a stripe. Su última película La ragazza ha volato, participó en la 78 edición del Festival de Cine de Venecia.